Nastavení aktualizace se skládá z určení zdroje aktualizace, tj. z nastavení aktualizačních serverů a autorizace vůči těmto serverům. Standardně je Aktualizační server přednastavený na možnost Automatický výběr serveru. Toto nastavení zajistí aktualizaci z některého z aktualizačních serverů společnosti ESET, se zřetelem na momentální zatížení jednotlivých aktualizačních serverů. Konfigurace aktualizace je přístupná ve stromu Pokročilých nastavení aplikace ESET NOD32 Antivirus ve větvi Aktualizace.
Seznam existujících aktualizačních serverů je k dispozici v rozevíracím seznamu Aktualizační server. Přidat nový server je možné tlačítkem v části Nastavení aktualizace pro zvolený profil a potom tlačítkem Přidat.
K autorizaci vůči aktualizačním serverům je nutné použít Přihlašovací jméno a Přihlašovací heslo, které byly vygenerovány pro uživatele a zaslány společností ESET, spol. s r.o. po zakoupení licence produktu.