Protokol POP3 je nejrozšířenější protokol, který slouží k příjímání e-mailové komunikace prostřednictvím poštovního klienta. Aplikace ESET NOD32 Antivirus zabezpečuje ochranu tohoto protokolu bez ohledu na používaného klienta.
Modul zabezpečující kontrolu se zavádí při spuštění operačního systému a po celou dobu je zaveden v paměti. Pro správné fungování stačí zkontrolovat, zde je modul zapnut, a kontrola protokolu POP3 je prováděna automaticky bez nutnosti konfigurace poštovního klienta. Standardně je kontrolována komunikace na portu 110, v případě komunikace lze přidat používaný port. Čísla portů se oddělují čárkou.
Není kontrolována šifrovaná komunikace.