For at redningsmediet (cd/dvd/USB) kan bruges effektivt, skal du sørge for, at computeren starter fra ESET SysRescue-bootmediet. Bootrækkefølgen kan ændres i BIOS-opsætningen. Du kan også starte bootmenuen under opstart af computeren – sædvanligvis ved hjælp af en af tasterne F9-F12 afhængigt af versionen af dit bundkort/BIOS.
Efter opstart starter ESS/ENA. Da ESET SysRescue kun bruges i specifikke situationer, er nogle beskyttelsesmoduler og programfunktioner, der findes i det almindelige ESS/ENA, ikke nødvendige. Listen er begrænset til Computerscanning, Opdatering og visse afsnit i Opsætning. Muligheden for at opdatere virussignaturdatabasen er den vigtigste funktion i ESET SysRescue. Det anbefales, at du opdaterer programmet, før du starter en computerscanning.