Karantiini põhiülesandeks on nakatunud failide ohutu salvestamine. Failid tuleb panna karantiini, kui neid ei saa puhastada, kui nende kustutamine ei ole turvaline ega soovitatav või kui viirusetõrje ei suutnud neid tuvastada.
Kasutaja võib karantiini saata iga faili omal äranägemisel. See on soovitatav, kui fail käitub kahtlaselt, kuid viirusetõrjekontrollis vahele ei ole jäänud. Karantiini paigutatud failid võib esitada analüüsimiseks ESET-i viiruselaborile.
Karantiinikausta salvestatud faile saab vaadata tabelis, kus on näha karantiini saatmise kuupäev ja kellaaeg, nakatunud faili esialgse asukoha tee, maht baitides, põhjus (kasutaja lisatud…) ja ohtude arv (nt mitut sissetungi sisaldava arhiivi puhul).