Meilikliendi kaitse tagab POP3-protokolli kaudu toimuva meilisuhtluse kontrolli. ESET NOD32 Antivirus kontrollib Microsoft Outlooki lisandprogrammi abil meilikliendi kogu suhtlust (POP3, MAPI, IMAP, HTTP). Siseneva teate uurimisel kasutab programm kontrollimootori ThreatSense kõiki kaasaegseid kontrollimeetodeid. See tähendab, et ründevara tuvastamine toimub isegi enne võrdlemist viirusesignatuuride andmebaasiga. POP3-protokolli põhise side kontroll ei sõltu kasutatavast meilikliendist.