Reaaliaikainen tiedostojärjestelmän suojaus hallitsee kaikkia järjestelmän virustorjuntaan liittyviä tapahtumia. Kaikille tiedostoille suoritetaan haitallisen koodin tarkistus, kun niitä avataan, luodaan tai suoritetaan tietokoneessa. Reaaliaikainen tiedostojärjestelmän suojaus käynnistetään tietokoneen käynnistyksen yhteydessä.