Izbornik Alati sadrži module koji pojednostavnjuju administriranje programa i nude dodatne mogućnosti naprednim korisnicima. Taj je izbornik dostupan samo u naprednom načinu rada i obuhvaća sljedeće alate:
Dnevnici
Karantena
Planer
SysInspector
Pošalji datoteku na analizu… – omogućuje slanje sumnjive datoteke na analizu laboratorijima tvrtke ESET. Dijaloški prozor koji se prikazuje nakon klika na tu mogućnost opisan je u odjeljku o slanju datoteke.
Stvaranje CD-a za oporavak – pokreće Čarobnjak za stvaranje CD-a za oporavak.