A megtisztítási beállítások meghatározzák, hogy hogyan működjön a víruskereső fertőzött fájlok megtisztítása során. A megtisztításnak a következő három szintje létezik:
Figyelmeztetés
Alapbeállítás módban a teljes tömörített fájl csak akkor törlődik, ha fertőzött fájlokat tartalmaz. Ha szabályszerű fájlokat is tartalmaz, akkor a fájl nem törlődik. Ha a program Automatikusan megtisztít módban fertőzött tömörített fájlt észlel, akkor az egész fájl törlődik akkor is, ha nem fertőzött fájlokat is tartalmaz.
Nincs megtisztítás
A fertőzött fájlok megtisztítása nem történik meg automatikusan. A program megjelenít egy figyelmeztető ablakot, és a felhasználó választhat a műveletek közül.
Alapértelmezett szint
A program megkísérli a fertőzött fájlok automatikus megtisztítását vagy törlését. Ha nem lehetséges a megfelelő lehetőség automatikus kiválasztása, akkor a program választási lehetőségeket kínál fel a következő műveletekre vonatkozóan. A választható műveletek akkor is megjelennek, ha egy előre definiált műveletet nem lehetett végrehajtani.
Teljes megtisztítás
A program az összes fertőzött fájlt (köztük a tömörített fájlokat is) megtisztítja vagy törli. Az egyedüli kivételek a rendszerfájlok. Ha nem lehetséges a megtisztítás, a program egy figyelmeztető ablakban ajánl fel egy műveletet.