E-mailbeveiliging biedt controle over e-mailcommunicatie die wordt ontvangen via het POP3-protocol. Met behulp van het invoegtoepassingsprogramma voor Microsoft Outlook biedt ESET NOD32 Antivirus controle over alle communicatie via de e-mailclient (POP3, MAPI, IMAP, HTTP). Bij het onderzoeken van binnenkomende berichten, maakt het programma gebruik van alle geavanceerde scanmethoden die beschikbaar worden gesteld door de ThreatSense-scanengine. Dit betekent dat detectie van schadelijke programma’s plaatsvindt zelfs nog voordat zij worden vergeleken met de virussignaturendatabase. Het scannen van communicatie via het POP3-protocol gebeurt onafhankelijk van de gebruikte e-mailclient.