W ramach podejmowanych środków bezpieczeństwa program ESET Smart Security sprawdza pocztę e-mail. Dlatego też, aby móc przenosić zainfekowane lub niepożądane wiadomości do odpowiednich folderów w programie poczty e-mail, program ESET Smart Security musi być z nim zintegrowany. Aby włączyć okno integracji, należy kliknąć menu Ustawienia, kliknąć opcję Otwórz całe drzewo ustawień zaawansowanych i wybrać opcję – Integracja z programami poczty e-mail Obecnie obsługiwane są następujące programy pocztowe: Microsoft Outlook, Outlook Express, Windows Mail, Windows Live Mail i Mozilla Thunderbird.
Aby włączyć integrację programu ESET NOD32 Antivirus z programem poczty e-mail, należy zaznaczyć odpowiednie pola wyboru w oknie ustawień integracji.
Opcję Wyłącz sprawdzanie po zmianie zawartości skrzynki odbiorczej należy wybrać, jeśli system działa wolniej niż zwykle podczas pracy z klientem poczty e-mail. Może to mieć miejsce podczas pobierania poczty z Kerio Outlook Connector Store.