Skanowanie protokołu POP3 stanowi ważny element zabezpieczeń komunikacji za pośrednictwem poczty e-mail. Program ESET Smart Security umożliwia określanie aplikacji używanych jako programy do obsługi poczty e-mail, dzięki czemu strumień komunikacji z serwerem poczty jest sprawdzany w poszukiwaniu szkodliwego kodu.
Dostęp do listy aplikacji oznaczonych jako programy poczty e-mail można uzyskać w oknie Ustawienia zaawansowane programu ESET Smart Security (klawisz F5). Należy wybrać kolejno opcje Antywirus i antyspyware > Ochrona poczty e-mail > Protokoły POP3, POP3S > Programy poczty e-mail. W tym oknie programu ESET Smart Security wyświetlana jest lista wykrytych zainstalowanych aplikacji, które użytkownik może oznaczyć. Jeśli żądanej aplikacji nie ma na liście, należy kliknąć przycisk Dodaj, aby ją dodać do listy.