Главное назначение карантина состоит в изоляции и безопасном хранении зараженных файлов. Файлы должны помещаться на карантин, если они не могут быть вылечены, или не могут быть безопасно удалены, или удаление не рекомендуется, или они не могут быть однозначно отнесены к зараженным.
Пользователь может поместить на карантин любой файл по выбору. Рекомендуется помещать на карантин файлы с подозрительной активностью, которые, тем не менее, не определяются модулем сканирования как зараженные. Изолированные файлы могут быть переданы в лабораторию ESET для дальнейшего анализа.
Информация о файлах, помещенных на карантин, находится в таблице. Она содержит дату и время помещения на карантин, путь к исходному расположению файла в системе, его размер в байтах, причину помещения на карантин (например, помещен пользователем) и количество обнаруженных вирусов (полезно, если файл содержит несколько вирусов).