ESET NOD32 Antivírus pridáva súbory do karantény automaticky pri ich mazaní (pokiaľ užívateľ vo varovnom okne nezruší túto možnosť). Ak to však užívateľ uzná za vhodné, môže pomocou tlačítka Presunúť presunúť hocijaký podozrivý súbor do karantény manuálne. V takomto prípade sa však súbor zo svojho pôvodného umiestnenia nezmaže. Okrem tlačítka Pridať je možné na tento účel využiť po kliknutí pravým tlačítkom myši na plochu karantény aj kontextové menu z ktorého zvolíte možnosť .