Головне завдання карантину – безпечно зберігати інфіковані файли. Файли слід помістити в карантин, якщо їх неможливо очистити, якщо їх видалення може бути не безпечним або не рекомендованим, або якщо антивірусний захист не повинен їх виявляти.
Користувач може вибрати будь-який файл для поміщення в карантин. Це рекомендується робити, коли файл веде себе підозріло або не виявляється антивірусним сканером. Із карантину файли можна відправити на аналіз до антивірусної лабораторії ESET.
Файли, що зберігаються в папці карантину, можна переглядати в таблиці, де показано дату і час поміщення в карантин, путь до вихідного місця розташування інфікованого файлу, його розмір в байтах, причину (додано користувачем…) та число загроз (наприклад, якщо це архів, що містить багато загроз).